FASTQ 檔案介紹
隨著次世代定序 (NGS) 越來越普及,產生的資料越來越多,Fastq 這種描述鹼基序列 (Nucleotide Sequence) 的檔案格式也使用的越來越多,本篇想要整理一些有關 Fastq 檔案介紹,像是 Fastq Data Format 與如何利用 Fastq 做 Quality Control (QC)?
詳細內容想方涉法, France, Taiwan, Health, Information Technology
隨著次世代定序 (NGS) 越來越普及,產生的資料越來越多,Fastq 這種描述鹼基序列 (Nucleotide Sequence) 的檔案格式也使用的越來越多,本篇想要整理一些有關 Fastq 檔案介紹,像是 Fastq Data Format 與如何利用 Fastq 做 Quality Control (QC)?
詳細內容因緣際會之下開始使用 Google Storage 的服務,所以想說要用一篇文章記錄,由於 Google Cloud 的服務五花八門非常多樣化,所以這邊主要會專注在介紹 Google Storage,包含安裝與一些簡單的操作。
詳細內容Cromwell 是一個用來執行工作流敘述語言 WDL (workflow description language) 的平台,他是由 Broad Institute 開發的一個開源專案,Cromwell 比較厲害的地方是可以利用不同的雲平台當作他的後台來跑 WDL 的工作流腳本,例如亞馬遜的 AWS 或是 Google Cloud,以下提供一個 AWS 介紹 Cromwell 的影片,本篇想要簡單記錄一些有關 Cromwell 的基本知識。
詳細內容生物資訊領域是近幾年來很熱門的一個領域,本篇紀錄有關 VCF – Variant Calling Format 基因變異儲存格式檔案的處理過程,有關於 VCF 的簡單介紹可以參考連結,也可以參考 Wikipedia 裡面關於 VCF 的介紹,一個 VCF 檔案大致上長成以下的樣子
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